Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01738 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01738 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01738 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01738 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01738 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01738 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01738 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01738 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01738 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01738 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01738 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01738 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01738 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01738 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01738 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01738 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01738 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01738 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01738 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01738 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01738 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01738 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01738 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01738 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01738 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01738 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01738 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01738 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01738 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01738 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01738 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01738 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01738 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01738 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01738 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01738 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01738 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01738 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01738 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01738 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01738 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01738 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01738 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01738 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01738 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01738 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01738 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01738 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01738 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01738 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01738 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01738 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01738 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01738 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01738 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01738 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01738 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01738 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01738 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01738 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01738 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01738 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01738 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01738 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01738 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01738 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01738 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01738 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01738 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01738 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01738 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01738 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms