Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01673 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01673 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01673 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01673 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01673 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01673 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01673 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01673 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
P01673 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01673 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01673 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01673 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01673 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01673 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01673 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01673 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
P01673 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01673 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01673 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01673 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01673 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P01673 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01673 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01673 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01673 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01673 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01673 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01673 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01673 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01673 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01673 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P01673 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01673 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01673 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01673 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01673 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01673 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01673 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01673 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01673 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01673 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01673 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01673 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01673 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01673 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01673 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01673 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P01673 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P01673 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01673 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01673 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01673 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01673 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
P01673 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01673 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01673 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01673 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01673 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01673 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01673 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01673 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01673 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01673 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01673 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01673 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01673 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01673 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01673 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01673 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01673 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01673 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01673 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01673 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01673 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01673 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01673 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01673 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01673 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
P01673 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01673 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01673 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01673 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01673 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01673 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01673 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01673 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01673 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
P01673 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01673 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01673 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01673 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01673 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01673 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01673 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01673 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01673 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01673 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01673 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01673 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms