Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01659 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01659 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01659 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01659 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01659 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01659 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01659 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01659 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01659 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01659 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01659 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01659 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01659 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01659 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01659 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01659 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01659 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01659 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01659 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01659 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01659 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01659 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01659 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01659 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01659 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01659 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01659 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01659 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01659 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01659 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01659 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01659 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01659 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01659 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01659 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01659 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01659 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01659 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01659 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01659 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01659 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01659 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01659 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01659 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01659 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01659 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01659 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01659 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01659 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01659 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01659 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01659 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01659 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01659 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01659 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01659 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01659 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01659 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01659 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01659 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01659 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01659 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01659 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01659 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01659 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01659 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01659 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01659 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01659 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01659 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01659 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01659 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01659 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01659 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01659 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01659 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01659 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01659 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01659 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01659 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01659 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01659 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01659 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01659 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01659 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01659 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01659 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01659 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01659 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01659 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01659 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms