Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01645 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01645 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01645 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01645 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01645 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01645 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01645 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01645 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
P01645 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
P01645 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01645 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01645 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01645 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01645 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01645 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01645 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
P01645 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
P01645 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01645 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01645 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01645 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01645 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01645 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01645 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01645 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01645 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01645 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01645 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01645 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01645 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01645 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01645 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01645 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01645 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01645 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01645 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01645 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01645 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01645 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01645 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01645 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01645 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01645 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01645 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01645 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01645 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
P01645 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01645 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01645 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01645 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01645 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
P01645 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01645 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01645 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01645 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01645 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01645 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
P01645 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01645 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
P01645 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01645 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01645 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01645 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01645 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
P01645 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01645 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
P01645 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01645 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01645 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01645 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
P01645 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P01645 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
P01645 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P01645 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P01645 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P01645 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
P01645 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01645 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01645 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01645 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01645 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
P01645 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01645 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01645 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01645 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01645 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01645 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01645 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01645 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
P01645 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01645 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01645 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01645 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
P01645 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01645 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01645 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01645 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01645 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01645 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms