Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA2P01563 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA2P01563 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA2P01563 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA2P01563 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA2P01563 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFNA2P01563 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA2P01563 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA2P01563 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA2P01563 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA2P01563 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA2P01563 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA2P01563 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA2P01563 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA2P01563 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA2P01563 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA2P01563 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA2P01563 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA2P01563 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA2P01563 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA2P01563 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA2P01563 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA2P01563 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA2P01563 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA2P01563 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA2P01563 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA2P01563 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA2P01563 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA2P01563 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFNA2P01563 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA2P01563 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA2P01563 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms