Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTAP01040 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTAP01040 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTAP01040 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTAP01040 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTAP01040 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTAP01040 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTAP01040 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTAP01040 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTAP01040 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTAP01040 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTAP01040 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTAP01040 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTAP01040 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTAP01040 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSTAP01040 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSTAP01040 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTAP01040 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTAP01040 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTAP01040 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTAP01040 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTAP01040 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTAP01040 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTAP01040 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTAP01040 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTAP01040 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTAP01040 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTAP01040 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTAP01040 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTAP01040 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTAP01040 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTAP01040 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTAP01040 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTAP01040 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTAP01040 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTAP01040 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTAP01040 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTAP01040 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTAP01040 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTAP01040 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTAP01040 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTAP01040 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTAP01040 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTAP01040 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTAP01040 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTAP01040 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTAP01040 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTAP01040 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTAP01040 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTAP01040 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTAP01040 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTAP01040 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTAP01040 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTAP01040 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTAP01040 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTAP01040 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSTAP01040 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTAP01040 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTAP01040 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTAP01040 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTAP01040 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTAP01040 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTAP01040 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTAP01040 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTAP01040 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTAP01040 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTAP01040 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTAP01040 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTAP01040 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTAP01040 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTAP01040 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTAP01040 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTAP01040 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTAP01040 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTAP01040 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTAP01040 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTAP01040 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTAP01040 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTAP01040 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTAP01040 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSTAP01040 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTAP01040 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTAP01040 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTAP01040 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTAP01040 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTAP01040 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTAP01040 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSTAP01040 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTAP01040 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTAP01040 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTAP01040 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSTAP01040 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms