Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ASS1P00966 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ASS1P00966 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ASS1P00966 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASS1P00966 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASS1P00966 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASS1P00966 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASS1P00966 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASS1P00966 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASS1P00966 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASS1P00966 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASS1P00966 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASS1P00966 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ASS1P00966 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ASS1P00966 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASS1P00966 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASS1P00966 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASS1P00966 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASS1P00966 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASS1P00966 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASS1P00966 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASS1P00966 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASS1P00966 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASS1P00966 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASS1P00966 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASS1P00966 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASS1P00966 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASS1P00966 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASS1P00966 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASS1P00966 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASS1P00966 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASS1P00966 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASS1P00966 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASS1P00966 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASS1P00966 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASS1P00966 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASS1P00966 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASS1P00966 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASS1P00966 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASS1P00966 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASS1P00966 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASS1P00966 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASS1P00966 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASS1P00966 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASS1P00966 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASS1P00966 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASS1P00966 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASS1P00966 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASS1P00966 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASS1P00966 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASS1P00966 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASS1P00966 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ASS1P00966 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASS1P00966 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASS1P00966 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASS1P00966 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASS1P00966 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASS1P00966 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASS1P00966 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASS1P00966 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASS1P00966 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASS1P00966 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASS1P00966 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASS1P00966 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASS1P00966 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASS1P00966 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASS1P00966 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASS1P00966 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASS1P00966 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ASS1P00966 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASS1P00966 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASS1P00966 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASS1P00966 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASS1P00966 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASS1P00966 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASS1P00966 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASS1P00966 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASS1P00966 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASS1P00966 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASS1P00966 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASS1P00966 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASS1P00966 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASS1P00966 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASS1P00966 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASS1P00966 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ASS1P00966 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASS1P00966 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASS1P00966 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms