Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abl1P00520 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abl1P00520 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abl1P00520 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abl1P00520 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abl1P00520 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abl1P00520 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abl1P00520 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abl1P00520 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abl1P00520 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms