Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DNAL4O96015 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNAL4O96015 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DNAL4O96015 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms