Protein–RNA interactions for Protein: O95470

SGPL1, Sphingosine-1-phosphate lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPL1O95470 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGPL1O95470 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SGPL1O95470 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SGPL1O95470 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGPL1O95470 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGPL1O95470 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms