Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNFRSF6BO95407 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms