Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMC2O95347 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC2O95347 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC2O95347 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC2O95347 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC2O95347 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC2O95347 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC2O95347 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC2O95347 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC2O95347 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC2O95347 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC2O95347 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC2O95347 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC2O95347 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC2O95347 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC2O95347 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC2O95347 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC2O95347 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC2O95347 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC2O95347 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC2O95347 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC2O95347 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMC2O95347 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMC2O95347 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC2O95347 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC2O95347 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC2O95347 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC2O95347 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC2O95347 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC2O95347 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC2O95347 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC2O95347 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC2O95347 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC2O95347 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC2O95347 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC2O95347 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC2O95347 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC2O95347 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC2O95347 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC2O95347 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC2O95347 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC2O95347 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC2O95347 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC2O95347 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC2O95347 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC2O95347 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC2O95347 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC2O95347 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC2O95347 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC2O95347 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC2O95347 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC2O95347 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC2O95347 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC2O95347 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC2O95347 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC2O95347 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC2O95347 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC2O95347 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC2O95347 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC2O95347 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC2O95347 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC2O95347 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC2O95347 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC2O95347 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC2O95347 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC2O95347 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC2O95347 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC2O95347 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC2O95347 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC2O95347 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC2O95347 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC2O95347 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC2O95347 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC2O95347 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC2O95347 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC2O95347 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC2O95347 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC2O95347 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC2O95347 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC2O95347 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC2O95347 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC2O95347 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC2O95347 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC2O95347 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC2O95347 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC2O95347 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC2O95347 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC2O95347 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC2O95347 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC2O95347 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC2O95347 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC2O95347 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC2O95347 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC2O95347 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMC2O95347 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC2O95347 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC2O95347 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMC2O95347 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC2O95347 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC2O95347 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms