Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1O95273 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1O95273 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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