Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LETM1O95202 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LETM1O95202 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LETM1O95202 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LETM1O95202 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LETM1O95202 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LETM1O95202 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LETM1O95202 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LETM1O95202 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LETM1O95202 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LETM1O95202 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LETM1O95202 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LETM1O95202 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LETM1O95202 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LETM1O95202 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LETM1O95202 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LETM1O95202 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LETM1O95202 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LETM1O95202 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LETM1O95202 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LETM1O95202 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LETM1O95202 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LETM1O95202 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LETM1O95202 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LETM1O95202 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LETM1O95202 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LETM1O95202 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LETM1O95202 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LETM1O95202 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LETM1O95202 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LETM1O95202 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LETM1O95202 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LETM1O95202 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LETM1O95202 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LETM1O95202 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LETM1O95202 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LETM1O95202 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LETM1O95202 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LETM1O95202 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LETM1O95202 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LETM1O95202 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LETM1O95202 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LETM1O95202 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LETM1O95202 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LETM1O95202 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LETM1O95202 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LETM1O95202 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LETM1O95202 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LETM1O95202 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
LETM1O95202 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LETM1O95202 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LETM1O95202 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LETM1O95202 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LETM1O95202 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LETM1O95202 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LETM1O95202 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LETM1O95202 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LETM1O95202 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LETM1O95202 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LETM1O95202 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LETM1O95202 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LETM1O95202 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LETM1O95202 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LETM1O95202 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LETM1O95202 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LETM1O95202 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LETM1O95202 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LETM1O95202 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LETM1O95202 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LETM1O95202 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LETM1O95202 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LETM1O95202 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LETM1O95202 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LETM1O95202 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LETM1O95202 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LETM1O95202 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LETM1O95202 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LETM1O95202 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LETM1O95202 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LETM1O95202 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LETM1O95202 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LETM1O95202 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LETM1O95202 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LETM1O95202 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LETM1O95202 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LETM1O95202 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LETM1O95202 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LETM1O95202 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LETM1O95202 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LETM1O95202 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LETM1O95202 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LETM1O95202 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LETM1O95202 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LETM1O95202 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LETM1O95202 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LETM1O95202 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LETM1O95202 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LETM1O95202 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LETM1O95202 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LETM1O95202 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms