Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKD3O94806 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD3O94806 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD3O94806 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms