Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itm2bO89051 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itm2bO89051 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itm2bO89051 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Itm2bO89051 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itm2bO89051 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itm2bO89051 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itm2bO89051 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms