Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setdb1O88974 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Setdb1O88974 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Setdb1O88974 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Setdb1O88974 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setdb1O88974 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms