Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcn2O88968 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcn2O88968 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcn2O88968 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcn2O88968 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcn2O88968 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms