Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BlmO88700 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
BlmO88700 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BlmO88700 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BlmO88700 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
BlmO88700 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BlmO88700 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
BlmO88700 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BlmO88700 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BlmO88700 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BlmO88700 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BlmO88700 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BlmO88700 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BlmO88700 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BlmO88700 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BlmO88700 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
BlmO88700 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BlmO88700 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BlmO88700 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BlmO88700 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BlmO88700 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
BlmO88700 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
BlmO88700 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BlmO88700 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
BlmO88700 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
BlmO88700 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
BlmO88700 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BlmO88700 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BlmO88700 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BlmO88700 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
BlmO88700 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
BlmO88700 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BlmO88700 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BlmO88700 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
BlmO88700 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
BlmO88700 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BlmO88700 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
BlmO88700 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BlmO88700 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
BlmO88700 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
BlmO88700 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
BlmO88700 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
BlmO88700 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
BlmO88700 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
BlmO88700 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
BlmO88700 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
BlmO88700 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
BlmO88700 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
BlmO88700 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
BlmO88700 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BlmO88700 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
BlmO88700 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BlmO88700 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BlmO88700 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
BlmO88700 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
BlmO88700 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BlmO88700 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BlmO88700 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
BlmO88700 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BlmO88700 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BlmO88700 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BlmO88700 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
BlmO88700 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
BlmO88700 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BlmO88700 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BlmO88700 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BlmO88700 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BlmO88700 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BlmO88700 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BlmO88700 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
BlmO88700 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BlmO88700 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BlmO88700 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BlmO88700 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BlmO88700 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BlmO88700 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BlmO88700 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
BlmO88700 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BlmO88700 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
BlmO88700 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BlmO88700 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BlmO88700 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BlmO88700 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BlmO88700 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
BlmO88700 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BlmO88700 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BlmO88700 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BlmO88700 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
BlmO88700 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BlmO88700 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BlmO88700 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BlmO88700 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BlmO88700 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
BlmO88700 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BlmO88700 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
BlmO88700 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BlmO88700 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BlmO88700 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
BlmO88700 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
BlmO88700 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms