Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClppO88696 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClppO88696 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClppO88696 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClppO88696 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClppO88696 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClppO88696 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ClppO88696 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClppO88696 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClppO88696 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClppO88696 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClppO88696 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClppO88696 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClppO88696 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClppO88696 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClppO88696 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClppO88696 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClppO88696 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ClppO88696 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ClppO88696 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClppO88696 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ClppO88696 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ClppO88696 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClppO88696 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClppO88696 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClppO88696 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClppO88696 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClppO88696 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClppO88696 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClppO88696 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClppO88696 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClppO88696 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClppO88696 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClppO88696 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClppO88696 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClppO88696 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClppO88696 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClppO88696 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClppO88696 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClppO88696 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClppO88696 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClppO88696 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClppO88696 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ClppO88696 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClppO88696 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClppO88696 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClppO88696 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClppO88696 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClppO88696 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClppO88696 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClppO88696 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClppO88696 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClppO88696 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClppO88696 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClppO88696 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClppO88696 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClppO88696 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ClppO88696 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClppO88696 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ClppO88696 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClppO88696 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClppO88696 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClppO88696 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClppO88696 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClppO88696 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ClppO88696 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClppO88696 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClppO88696 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClppO88696 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ClppO88696 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClppO88696 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClppO88696 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClppO88696 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClppO88696 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClppO88696 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClppO88696 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClppO88696 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClppO88696 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClppO88696 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClppO88696 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClppO88696 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClppO88696 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClppO88696 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClppO88696 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClppO88696 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClppO88696 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClppO88696 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClppO88696 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClppO88696 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ClppO88696 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms