Protein–RNA interactions for Protein: O88477

Igf2bp1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igf2bp1O88477 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igf2bp1O88477 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Igf2bp1O88477 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Igf2bp1O88477 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igf2bp1O88477 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms