Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnnt1O88346 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnnt1O88346 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnnt1O88346 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms