Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfdp1O88271 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfdp1O88271 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfdp1O88271 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfdp1O88271 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms