Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT33AO76009 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT33AO76009 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT33AO76009 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms