Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LGR5O75473 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LGR5O75473 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LGR5O75473 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LGR5O75473 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LGR5O75473 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LGR5O75473 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LGR5O75473 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LGR5O75473 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LGR5O75473 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LGR5O75473 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LGR5O75473 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LGR5O75473 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LGR5O75473 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LGR5O75473 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LGR5O75473 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGR5O75473 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGR5O75473 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGR5O75473 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGR5O75473 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGR5O75473 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGR5O75473 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LGR5O75473 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LGR5O75473 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LGR5O75473 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LGR5O75473 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LGR5O75473 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LGR5O75473 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LGR5O75473 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LGR5O75473 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LGR5O75473 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LGR5O75473 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LGR5O75473 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LGR5O75473 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LGR5O75473 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LGR5O75473 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LGR5O75473 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGR5O75473 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGR5O75473 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LGR5O75473 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LGR5O75473 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LGR5O75473 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LGR5O75473 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LGR5O75473 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LGR5O75473 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LGR5O75473 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LGR5O75473 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LGR5O75473 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LGR5O75473 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LGR5O75473 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LGR5O75473 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LGR5O75473 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LGR5O75473 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LGR5O75473 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LGR5O75473 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LGR5O75473 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LGR5O75473 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LGR5O75473 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LGR5O75473 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LGR5O75473 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LGR5O75473 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LGR5O75473 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LGR5O75473 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LGR5O75473 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LGR5O75473 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LGR5O75473 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LGR5O75473 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LGR5O75473 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LGR5O75473 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LGR5O75473 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LGR5O75473 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LGR5O75473 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LGR5O75473 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LGR5O75473 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LGR5O75473 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LGR5O75473 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LGR5O75473 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LGR5O75473 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LGR5O75473 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LGR5O75473 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LGR5O75473 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LGR5O75473 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LGR5O75473 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.1 ms