Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GADD45BO75293 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GADD45BO75293 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GADD45BO75293 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GADD45BO75293 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GADD45BO75293 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GADD45BO75293 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GADD45BO75293 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GADD45BO75293 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GADD45BO75293 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms