Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP1O75113 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP1O75113 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4BP1O75113 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4BP1O75113 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms