Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRP4O75096 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP4O75096 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP4O75096 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP4O75096 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP4O75096 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP4O75096 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP4O75096 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP4O75096 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP4O75096 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRP4O75096 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRP4O75096 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP4O75096 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP4O75096 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP4O75096 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP4O75096 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP4O75096 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP4O75096 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP4O75096 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP4O75096 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP4O75096 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP4O75096 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP4O75096 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP4O75096 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP4O75096 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP4O75096 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP4O75096 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP4O75096 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP4O75096 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP4O75096 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP4O75096 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP4O75096 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP4O75096 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP4O75096 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP4O75096 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP4O75096 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP4O75096 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP4O75096 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP4O75096 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP4O75096 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP4O75096 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP4O75096 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP4O75096 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP4O75096 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP4O75096 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP4O75096 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP4O75096 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP4O75096 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP4O75096 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP4O75096 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP4O75096 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP4O75096 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP4O75096 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRP4O75096 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRP4O75096 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP4O75096 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP4O75096 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP4O75096 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP4O75096 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP4O75096 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP4O75096 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP4O75096 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP4O75096 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP4O75096 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP4O75096 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP4O75096 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP4O75096 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP4O75096 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP4O75096 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP4O75096 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP4O75096 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP4O75096 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP4O75096 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP4O75096 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP4O75096 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP4O75096 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP4O75096 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP4O75096 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP4O75096 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP4O75096 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP4O75096 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP4O75096 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP4O75096 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP4O75096 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP4O75096 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP4O75096 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP4O75096 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP4O75096 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP4O75096 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP4O75096 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP4O75096 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP4O75096 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms