Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx7O70439 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx7O70439 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx7O70439 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx7O70439 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx7O70439 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx7O70439 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx7O70439 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx7O70439 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx7O70439 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx7O70439 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx7O70439 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx7O70439 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx7O70439 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms