Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp8O70404 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp8O70404 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms