Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOL3O60936 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOL3O60936 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOL3O60936 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOL3O60936 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOL3O60936 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NOL3O60936 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOL3O60936 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOL3O60936 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOL3O60936 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOL3O60936 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOL3O60936 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOL3O60936 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOL3O60936 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOL3O60936 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOL3O60936 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOL3O60936 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOL3O60936 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOL3O60936 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOL3O60936 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOL3O60936 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOL3O60936 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOL3O60936 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOL3O60936 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOL3O60936 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOL3O60936 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOL3O60936 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOL3O60936 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOL3O60936 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOL3O60936 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOL3O60936 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOL3O60936 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOL3O60936 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOL3O60936 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOL3O60936 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOL3O60936 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOL3O60936 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOL3O60936 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOL3O60936 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOL3O60936 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOL3O60936 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOL3O60936 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOL3O60936 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOL3O60936 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOL3O60936 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOL3O60936 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOL3O60936 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOL3O60936 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOL3O60936 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOL3O60936 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOL3O60936 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOL3O60936 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOL3O60936 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOL3O60936 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOL3O60936 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOL3O60936 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOL3O60936 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOL3O60936 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOL3O60936 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOL3O60936 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOL3O60936 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOL3O60936 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOL3O60936 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOL3O60936 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOL3O60936 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOL3O60936 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOL3O60936 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOL3O60936 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOL3O60936 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOL3O60936 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOL3O60936 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOL3O60936 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOL3O60936 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOL3O60936 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms