Protein–RNA interactions for Protein: O60739

EIF1B, Eukaryotic translation initiation factor 1b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF1BO60739 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF1BO60739 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF1BO60739 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms