Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD2O60548 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXD2O60548 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD2O60548 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms