Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
PLXNC1O60486 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PLXNC1O60486 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PLXNC1O60486 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
PLXNC1O60486 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PLXNC1O60486 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms