Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX16O60231 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX16O60231 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX16O60231 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX16O60231 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX16O60231 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DHX16O60231 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX16O60231 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX16O60231 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX16O60231 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX16O60231 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DHX16O60231 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX16O60231 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX16O60231 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX16O60231 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX16O60231 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX16O60231 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX16O60231 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX16O60231 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX16O60231 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX16O60231 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX16O60231 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX16O60231 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX16O60231 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX16O60231 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX16O60231 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX16O60231 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX16O60231 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX16O60231 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX16O60231 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX16O60231 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX16O60231 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DHX16O60231 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DHX16O60231 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DHX16O60231 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DHX16O60231 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX16O60231 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX16O60231 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX16O60231 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX16O60231 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX16O60231 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX16O60231 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX16O60231 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX16O60231 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX16O60231 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX16O60231 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX16O60231 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX16O60231 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX16O60231 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX16O60231 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX16O60231 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX16O60231 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX16O60231 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX16O60231 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX16O60231 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX16O60231 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX16O60231 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX16O60231 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX16O60231 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX16O60231 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX16O60231 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX16O60231 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DHX16O60231 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DHX16O60231 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DHX16O60231 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DHX16O60231 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DHX16O60231 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
DHX16O60231 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX16O60231 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX16O60231 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX16O60231 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX16O60231 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX16O60231 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX16O60231 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX16O60231 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX16O60231 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX16O60231 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX16O60231 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DHX16O60231 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DHX16O60231 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DHX16O60231 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX16O60231 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX16O60231 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX16O60231 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX16O60231 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX16O60231 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX16O60231 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX16O60231 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX16O60231 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms