Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KALRNO60229 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KALRNO60229 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KALRNO60229 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KALRNO60229 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KALRNO60229 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KALRNO60229 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KALRNO60229 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KALRNO60229 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KALRNO60229 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KALRNO60229 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KALRNO60229 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KALRNO60229 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KALRNO60229 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KALRNO60229 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KALRNO60229 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KALRNO60229 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KALRNO60229 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KALRNO60229 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KALRNO60229 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KALRNO60229 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KALRNO60229 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KALRNO60229 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KALRNO60229 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KALRNO60229 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KALRNO60229 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KALRNO60229 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KALRNO60229 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KALRNO60229 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KALRNO60229 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KALRNO60229 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KALRNO60229 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KALRNO60229 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KALRNO60229 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KALRNO60229 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KALRNO60229 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KALRNO60229 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KALRNO60229 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KALRNO60229 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KALRNO60229 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KALRNO60229 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KALRNO60229 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KALRNO60229 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KALRNO60229 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KALRNO60229 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KALRNO60229 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KALRNO60229 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KALRNO60229 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KALRNO60229 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KALRNO60229 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KALRNO60229 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KALRNO60229 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KALRNO60229 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KALRNO60229 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KALRNO60229 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KALRNO60229 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KALRNO60229 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KALRNO60229 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KALRNO60229 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KALRNO60229 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KALRNO60229 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KALRNO60229 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KALRNO60229 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KALRNO60229 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KALRNO60229 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KALRNO60229 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KALRNO60229 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KALRNO60229 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KALRNO60229 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KALRNO60229 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KALRNO60229 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KALRNO60229 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KALRNO60229 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KALRNO60229 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KALRNO60229 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KALRNO60229 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KALRNO60229 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KALRNO60229 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KALRNO60229 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KALRNO60229 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KALRNO60229 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KALRNO60229 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KALRNO60229 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KALRNO60229 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KALRNO60229 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KALRNO60229 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KALRNO60229 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KALRNO60229 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KALRNO60229 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KALRNO60229 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KALRNO60229 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KALRNO60229 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KALRNO60229 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KALRNO60229 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KALRNO60229 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KALRNO60229 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KALRNO60229 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KALRNO60229 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KALRNO60229 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KALRNO60229 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms