Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2a2O55143 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2a2O55143 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2a2O55143 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms