Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap1O55125 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nipsnap1O55125 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap1O55125 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms