Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SlkO54988 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SlkO54988 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SlkO54988 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SlkO54988 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SlkO54988 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SlkO54988 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SlkO54988 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SlkO54988 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SlkO54988 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SlkO54988 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SlkO54988 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SlkO54988 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SlkO54988 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SlkO54988 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SlkO54988 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SlkO54988 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SlkO54988 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SlkO54988 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SlkO54988 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SlkO54988 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SlkO54988 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SlkO54988 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SlkO54988 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SlkO54988 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SlkO54988 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SlkO54988 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SlkO54988 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SlkO54988 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SlkO54988 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SlkO54988 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SlkO54988 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SlkO54988 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SlkO54988 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SlkO54988 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SlkO54988 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SlkO54988 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SlkO54988 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SlkO54988 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SlkO54988 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SlkO54988 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SlkO54988 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SlkO54988 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SlkO54988 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SlkO54988 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SlkO54988 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SlkO54988 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms