Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Atp10aO54827 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atp10aO54827 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atp10aO54827 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atp10aO54827 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Atp10aO54827 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atp10aO54827 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms