Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cavin1O54724 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cavin1O54724 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cavin1O54724 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms