Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRICKLE3O43900 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRICKLE3O43900 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRICKLE3O43900 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms