Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENRO43583 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENRO43583 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENRO43583 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENRO43583 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENRO43583 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENRO43583 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENRO43583 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENRO43583 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENRO43583 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENRO43583 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENRO43583 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENRO43583 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENRO43583 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENRO43583 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENRO43583 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENRO43583 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENRO43583 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENRO43583 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENRO43583 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENRO43583 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENRO43583 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DENRO43583 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENRO43583 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENRO43583 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENRO43583 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENRO43583 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENRO43583 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENRO43583 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DENRO43583 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENRO43583 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENRO43583 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENRO43583 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENRO43583 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENRO43583 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENRO43583 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENRO43583 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENRO43583 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENRO43583 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENRO43583 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENRO43583 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENRO43583 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENRO43583 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENRO43583 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENRO43583 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENRO43583 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENRO43583 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENRO43583 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENRO43583 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENRO43583 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DENRO43583 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENRO43583 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENRO43583 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENRO43583 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENRO43583 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENRO43583 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENRO43583 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENRO43583 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENRO43583 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENRO43583 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENRO43583 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENRO43583 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENRO43583 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENRO43583 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENRO43583 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENRO43583 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENRO43583 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENRO43583 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENRO43583 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENRO43583 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENRO43583 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENRO43583 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENRO43583 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DENRO43583 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENRO43583 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENRO43583 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENRO43583 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENRO43583 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DENRO43583 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENRO43583 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENRO43583 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENRO43583 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENRO43583 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENRO43583 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENRO43583 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENRO43583 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENRO43583 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENRO43583 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENRO43583 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENRO43583 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENRO43583 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENRO43583 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENRO43583 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENRO43583 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DENRO43583 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DENRO43583 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENRO43583 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENRO43583 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DENRO43583 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DENRO43583 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 994.6 ms