Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD6O43541 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD6O43541 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD6O43541 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms