Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXO3O43524 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXO3O43524 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXO3O43524 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FOXO3O43524 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FOXO3O43524 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FOXO3O43524 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FOXO3O43524 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXO3O43524 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
FOXO3O43524 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXO3O43524 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms