Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DYNC1LI2O43237 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DYNC1LI2O43237 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DYNC1LI2O43237 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DYNC1LI2O43237 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms