Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHGDHO43175 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHGDHO43175 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHGDHO43175 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms