Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLXNB1O43157 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLXNB1O43157 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms