Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn6O35454 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn6O35454 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn6O35454 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clcn6O35454 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms