Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf5O35445 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf5O35445 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf5O35445 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms